三、僧众的功德：具备戒、定、慧、总持、辩才等不可思议的如海功德。
这以上所有皈依境，归纳起来汇集为上师，如果广义来讲，就是暂时的九种。由于把他们作为皈依境，尤其是本身具全风脉等，所以在皈依时脉清净为化身……
大士道的意乐，是以为遣除有寂一切衰败的心愿而皈依的。这样的心态，按照因相乘来讲，既是意乐差别，也是果皈依。因皈依是以具足三种特点（即佛为本师、法为道、僧为助伴）而皈依的。关于这个问题有两种观点，按照中转法轮的意趣，以因皈依作为因，获得佛果， 就承许是果皈依，承认（因皈依和果皈依）是真正能生所生的因果。末转法轮以上承认：“如来藏智”在基位有情的相续中以基住自然智慧存在着，它是恒常、不变、本体空性，如来三身的一切功德以无改任运的方式存在着。由于离基如来藏的智慧被客尘所障蔽，因此需要遣除它的方式或者二资粮的缘，然而并不承认它们是真正能生所生的因果，认为（因皈依）是能现前的外缘。
首先因皈依，包括相似的承诺皈依和真正随修道的皈依两种。
其一、相似的承诺皈依，以本师、道、助伴的方式念诵十万遍皈依偈。
其二、真正随修道的皈依：继因承诺皈依之后，迈入积累二资粮的所有门，就是随修道的皈依。这样的自然本智，是无则不生的因，没有认识它的本来面目之时就是众生，认识之后现前时就是佛陀。从一地开始，片面证悟了这一本智，从此以后次第证悟、修习，最终在十地相续末际，依靠道位的证法和十地相续末际的对治金刚喻定的智慧无余断除剩余的所断而成佛。本体本来清净、离客尘清净的佛陀就是果证法。佛陀心相续中具有的甚深和广大之法就是它，它包括抉择灭和非抉择灭两种。非抉择灭在众生的相续中，以如来藏智慧本体本来清净的方式存在着。抉择灭，是离客尘清净的部分——佛陀法身。这样的本智在众生相续中是如何存在的呢？就像剑存于剑鞘里、宝珠被淤泥所遮蔽一样，被客尘所障蔽着，消除它的方便——因皈依和果皈依分别是因和缘。
不共内皈依境三根本三宝到底是怎样的呢？
按照显宗的观点承许，殊胜化身是佛宝。在密宗的讲法中，一种承许是佛陀的受用圆满身是佛宝，认为上师是僧众，有信心的本尊和有缘的本尊是佛陀。还有一种观点，认为上师是佛宝，本尊是法宝，其余传承上师是持明内僧众。
关于上师是佛的道理，必须以教证、理证来证实。有关的教证，《五次第论》中所说“此即自然佛，唯一大本尊，尽赐诸窍诀，金刚师胜佛”等等。理证，上师的意是大智慧（法身），
上师的现象显似身体，传出语音，心现动念（是色身），法身的现象是色身，色身的本体是法身，这两者不可分割、无二无别就是双运金刚持。
关于本尊是法宝的道理，通常而言，新派旧派共同有四续部，瑜伽续部又包括外瑜伽和内瑜伽。内瑜伽中，宁玛派有甚深内三续部，新派有《胜乐金刚》、《喜金刚》、《密集金刚》，这所有法都包括教法和证法。其中教法，外密宗的教法是现声、闻声、表示，事、行、瑜伽外三续部。证法是能成熟的灌顶和能解脱的教言。恩赐能成熟和能解脱之教授的上师是佛，上师所恩赐的成熟、解脱之教授是法，实修的行人是持明内僧众。恩赐内三续部之入门的灌顶和能解脱之教言的上师是佛，能成熟和能解脱的教授是法宝，如此实修的行者是持明内僧众，三根本归集在三宝的自性中。
类别暂时可以分成九种，但归纳起来，就摄为独一无二的上师。
以上稍稍解释完皈依的含义，接下来实际修行，分为入座与座间两个阶段。入座，白天两座、夜晚两座四座或八座都可以。入座也包括入座的前行、入座的正行和入座的后行。入座的前行，身的要点、语的要点、心的要点和祈祷这四项在所有入座时都要运用。身的要点，作毗卢七法，解脱道的七法，身体放松、跏趺端直。语的要点，除垢气，除三次垢气或九次垢气，根据自己的信解而行。在除垢气时，观想自他从无始轮回以来所积的业、堕罪、破誓言、深道的一切障碍违缘通通变成黑气的形象，向外排放。心的要点，就是调整发心，首先去除所有恶劣的发心，改变无记的发心，以菩提心意乐扭转发心。祈祷，上师的形象改不改变都可以，观想：在头顶上十万瓣白色莲花的红黄色花蕊中央，日轮垫上狮子座层层叠放的柔软绫罗垫上，把自己的根本上师观成出家相或密咒师形象。必须以将上师视为真佛情不自禁的虔诚恭敬信心祈求所想之事，在修暇满难得时，祈祷上师加持自相续生起实现暇满人身价值的功德。随后，上师化光融入自己，再入定。 同样，不管是修共不共任何加行的时候，就需要祈祷上师心相续中的所有功德在自相续中生起，自己的心与上师的智慧融为一体而入定， 要知道这些内容类推普及所有入座。
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